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济南大学学报(自然科学版)2025年第01期:玉米乙烯响应因子亚家族的生物信息学鉴定与分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:李焰榕;谭孝婷;车荣会;

单位:济南大学生物科学与技术学院;

摘要:为了全面了解玉米APETALA2/乙烯响应因子(AP2/ERF)超家族中ERF亚家族成员在玉米生长发育和逆境过程中的作用,利用生物信息学手段鉴定和分析玉米Zea mays L.B73基因组ERF亚家族成员。结果表明:共鉴定到87个ERF基因且不均匀地分布在玉米的10条染色体上,蛋白序列长度为124~603 aa,蛋白质分子质量为13.23~65.44 kDa,理论等电点为4.44~10.84,亚细胞定位于细胞核;进化树分析显示,ERF基因被分为5个组,各组内的基因结构和保守基序的数量、分布等相似,但各组之间存在较大的差异,多数没有内含子,有内含子的基因占比为20.69%; ERF亚家族成员共有10个保守基序,其中前2个保守基序最为保守,且通常以串联方式存在于多数ERF亚家族成员中;启动子分析显示ZmERF基因含有大量光响应、激素响应、胁迫响应和生长发育相关元件,表明玉米ERF亚家族成员在玉米生长发育及非生物胁迫、生物胁迫方面发挥作用。

关键词:生物信息学;;玉米;;乙烯响应因子;;转录因子

基金资助:国家自然科学基金项目(41800333)