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作者：张以星;王争光;谭月;吴婷婷;齐浥颖;王宇浩;黄育敏;张积森;唐海宝;
单位：福建农林大学未来技术学院,海峡联合研究院,福建省海峡植物应用系统生物学重点实验室;福建农林大学农学院,海峡联合研究院,福建省海峡植物应用系统生物学重点实验室;广西大学农学院,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室;
摘要：随着高通量测序技术的快速发展，越来越多物种的基因组组装、注释，以及比较基因组学研究得到开展。尽管已有各类工具可以分别处理这些步骤，但用户对能够整合这些不同工具的解决方案的需求日益增加。在此，本文介绍了JCVI库，这是一个功能多样的基于Python的库，其模块化设计能够处理格式解析、图形生成、基因组挂载和植物表型提取等多种任务。该库以BSD-2-Clause许可证发布，用户可在https://github.com/tanghaibao/jcvi免费获取。JCVI提供了简洁统一的解决方案，简化了这些任务，使研究人员能够流畅地开展全面的基因组分析。
关键词：共线性分析;;表型提取;;基因组质量控制;;基因组挂载
基金资助：国家重点研发计划(2021YFF1000104-4,2021YFF1000101-5)资助
