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中国海洋大学学报(自然科学版)2025年第11期:澳洲异尾涡虫再生过程的基因共表达网络及关键基因的调控模式分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:蒲忠棋;姚立杰;常欣瑶;孙雪;李语丽;

单位:中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室;

摘要:针对原始双侧对称动物再生机制尚不明晰的现状,为解析澳洲异尾涡虫(Heterochaerus australis)这一无肠目(Acoela)典型动物再生过程分子机制的关键科学问题,本研究基于澳洲异尾涡虫各再生时期的头部组织与尾部组织表达谱数据,使用加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)技术,解析了头部组织与尾部组织再生过程中共有的关键基因调控网络。通过基因差异表达分析以及基因共表达模块相似性分析,鉴定出头部组织与尾部组织相似的基因共表达模块。基于KEGG功能分析发现,这些模块的基因参与细胞增殖、DNA复制、细胞能量平衡维持以及细胞异常增殖抑制等生物学过程,这表明这些模块共同保障澳洲异尾涡虫头部组织与尾部组织的正确再生。进一步,通过细分基因共表达网络子模块枢纽基因的功能以及表达模式,本研究揭示了澳洲异尾涡虫再生过程中头部组织与尾部组织共有的基因调控网络的级联表达模式。

关键词:澳洲异尾涡虫;;加权基因共表达网络分析(WGCNA);;转录组;;再生;;基因共表达模块;;枢纽基因;;差异表达基因

基金资助:国家自然科学基金项目(32222085)资助~~