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作者：同海欣1,2,3,4;汤旭升1,2,3,4;梁鹏1,2,3,4;尚林东1,2,3,4;赵志伟5;李备1,2,3,4,5
单位：1.中国科学院长春光学精密机械与物理研究所;2.中国科学院大学;3.应用光学国家重点实验室;4.中国科学院光学系统先进制造技术重点实验室;5.长春长光辰英生物科学仪器有限公司
摘要：为解决微生物菌落培养研究中菌落挑取、培养、鉴定工作量大、重复度高的问题，提出一种基于光学成像的菌落去重复挑选策略。通过宏观成像对菌落进行计数和定位，与通过微观成像获取的菌落特征信息结合，并使用贪心算法对获得特征信息的菌落进行挑选，实现菌落挑选的去重复工作。该方法成功建立了多维度菌落识别方法与技术路线，将200个菌落样本的挑选方案的获得缩减至5 min内，且当挑菌数与菌落样本种数之比为3时，菌落覆盖率超过90%。与传统的人工去重复和连续稀释法进行菌株挑选相比，基于光学成像的菌落挑选策略能够提高菌落挑选效率，降低人力资源成本，并有效提高挑菌的覆盖率。
关键词：菌落;去重复挑选;光学成像;挑选覆盖率
