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作者:马敏彪;武利恒;丁琳;金慧佳;赵丽莉;曹丁壬;王争光;
单位:浙江省畜牧技术推广与种畜禽监测总站;浙江华欣牧业有限公司;浙江大学动物科学学院;衢州市畜牧业发展中心;
摘要:旨在运用现代生物信息学技术,评估湖羊群体的遗传结构,构建详细的系谱记录。通过对40只湖羊种公羊进行单核苷酸多态性(SNP)位点检测,基于检测结果进行遗传结构分析、主成分分析和进化树构建。结果:在40只种公羊中,共检测得到952 214个SNPs;平均核苷酸多样性在0.212 9~0.242 5之间,平均观测杂合度大于平均期望杂合度,遗传分化程度值在0.370 2~0.452 4之间;状态同源(IBS)遗传距离在0.173 9~0.228 0之间,平均为0.220 9;主成分分析和系统进化树的结果一致,最终可以将40只种公羊分为14个家系,湖羊群体中大部分个体间的亲缘关系较远,具有较高的遗传多样性和选择潜力。本研究在全基因组水平上,分析了湖羊种公羊的遗传结构和亲缘关系,完善了系谱记录,为湖羊场后续育种、配种等提供了科学依据。
关键词:湖羊;单核苷酸多态性;遗传多样性;遗传结构;亲缘关系
基金资助:衢州市科技局项目(2023T019); 浙江省农业重大技术协同推广计划项目(2023ZDXT16); 浙江省科技厅项目(2023C04004); 浙江省畜禽新品种选育重大科技专项(2021C02068-6); 国家自然科学基金项目(32172724)