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基因组学与应用生物学2024年第08期:菲牛蛭、日本医蛭和宽体金线蛭差异表达基因比较研究

来源:期刊VIP网 时间:


作者:张万芳;刘嘉胜;李雪嫣;郑景辉;周维官;黄春梅;刘庆友;潘红平;

单位:广西大学动物科学技术学院,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室;广西中医药大学附属瑞康医院心内科;泰国天然水蛭素股份有限公司;南宁市蛭澳生物科技有限公司;

摘要:菲牛蛭(Hirudinaria manillensis)、日本医蛭(Hirudo nipponia)和宽体金线蛭(Whitmania pigra)作为中国广泛使用的药用水蛭,其主要功效为抗血栓、抗肿瘤、调脂和抗动脉粥样硬化等。在传统中药文化观念的推动下,水蛭的研究也日渐深入,然而有关不同物种水蛭的转录组分析还鲜有报道。本研究通过对菲牛蛭、日本医蛭和宽体金线蛭等3种水蛭的转录本进行分析,比较不同物种水蛭的基因表达模式,共构建不同物种水蛭不同体段的cDNA文库27个,发现了2 880个差异表达基因和183个差异表达的lncRNAs。结果表明,菲牛蛭、日本医蛭和宽体金线蛭的基因表达模式存在显著差异:在菲牛蛭vs日本医蛭中获得1 681个差异表达基因,在菲牛蛭vs宽体金线蛭中获得2 156个差异表达基因,在日本医蛭vs宽体金线蛭中获得468个差异表达基因,菲牛蛭较其他2种水蛭基因表达差异大,而日本医蛭与宽体金线蛭间基因表达差异较小。GO和KEGG富集的分析结果表明,菲牛蛭、日本医蛭和宽体金线蛭的差异表达基因主要与化合物的分解代谢、细胞骨架蛋白、横纹肌细胞分化、收缩纤维、酶激活剂活性和核糖体相关。与日本医蛭相比,菲牛蛭和宽体金线蛭中与纤维、细胞骨架蛋白和肌肉等发育相关的基因表达明显升高。此外,与抗凝血、抗炎及镇痛相关的基因在菲牛蛭中高表达,在宽体金线蛭中表达水平较低。本研究可为菲牛蛭、日本医蛭、宽体金线蛭的临床应用及作为中药治疗相关疾病提供依据。

关键词:菲牛蛭;日本医蛭;宽体金线蛭;差异表达基因

基金资助:广西中医药大学岐黄高层次人才团队培养项目(2021005); 泰国天然水蛭素股份有限公司共同资助