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作者:付丽枝;杨涌;于克妍;于立洋;王旋;张海娥;
单位:河北科技师范学院园艺科技学院;板栗产业技术教育部工程研究中心;河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室;河北省板栗产业协同创新中心;
摘要:SBP蛋白是一类广泛参与调节生长发育过程的植物特有转录因子。本研究从3种栗属植物中鉴定到58个SBP基因家族成员,并利用生物信息学方法对其染色体定位、蛋白理化性质、共线性关系等方面进行了分析。结果发现,所有栗属植物SBP基因家族成员在染色体上呈非均匀分布,其中3个SBP基因未被组装到染色体的大片段中。进化树分析发现栗属植物SBP基因家族可以分为7个小组,小组5中发生了基因的丢失和扩增。Motif分析发现所有SBP基因家族成员都包含保守的Motif1或Motif2。共线性基因对的Ka/Ks分析发现,SBP基因家族成员在栗属植物基因组内及组间正在经历纯化选择。转录组数据分析发现CmSBP基因家族在不同时期中国板栗芽与果实中的表达量变化明显。本研究结果可为后续栗属植物SBP基因功能研究提供理论基础。
关键词:栗属植物;;SBP基因家族;;选择压力;;生物信息学分析;;表达分析
基金资助:国家重点研发计划项目(2022YFD2200400);; 河北科技师范学院博士启动基金项目(2023YB026)