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作者：刘怡峰;蒙雨;李天行;蔡杏伟;谢松光;宋一清;
单位：海南大学海洋生物与水产学院;海南省海洋与渔业科学院;海南大学南海海洋资源利用国家重点实验室;
摘要：研究海南岛海域野生花鳗鲡（Anguilla marmorata）线粒体基因组序列，有助于理解不同鳗鲡属物种之间的亲缘关系，并为鳗鲡属鱼类的鉴定和系统进化提供科学依据。采用Illumina技术对2021年11月采自海南省陵水黎族自治县田新村加薪河的10尾花鳗鲡样品线粒体基因组进行测序，结果显示线粒体基因组全长为16 712 bp，碱基组成为A(34.30%)、C(25.93%)、T(24.57%)和G(15.20%);A+T含量为58.87%，呈现出明显的AT偏好性。线粒体基因组结构包含37个基因和1个控制区（D-loop）。对花鳗鲡13个蛋白质编码基因（protein-coding genes, PCGs）密码子的相对同义密码子使用度（RSCU）进行统计分析，发现除AGC和ATC外，其余密码子的RSCU均大于1，表明均为偏好性密码子；比较中国和印度尼西亚海域的花鳗鲡线粒体基因组，发现除COI和ND6基因外，其他PCGs的相似性均高于99%；进一步对同属的日本鳗鲡（A. japonica）、吕宋鳗鲡（A. luzonensis）、双色鳗鲡（A. bicolor）和云纹鳗鲡（A. nebulosa）线粒体基因组的13个PCGs进行两两比对分析，结果显示这5种鳗鲡属鱼类的PCGs的相似度为90%～97%。通过分析23种鳗鲡目鱼类线粒体基因组中13个PCGs的核苷酸序列，构建了系统进化树，成功地将花鳗鲡与其他鳗鲡属鱼类区分开来。研究结果表明花鳗鲡与内唇鳗鲡（A. interioris）同属一个分支，二者亲缘关系最近。
关键词：花鳗鲡;线粒体基因组;基因测序;系统发育分析;海南岛
基金资助：海南省科技专项项目(ZDYF2023SHFZ101,ZDYF2024SHFZ070); 海南省教育厅项目(Hnkyzc2022-4); 海南大学科研启动基金项目[KYQD(ZR)21130]
