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作者：孙瑞彬;白慧颖;袁春营;崔青曼;
单位：天津科技大学海洋与环境学院;
摘要：从养殖水体中筛选出高效去除亚硝酸盐菌株，并对其去除亚硝酸盐途径的基因表达进行探讨，可为其在亚硝酸盐代谢研究和水产养殖中的应用提供参考依据。采用稀释平板法从凡纳滨对虾养殖池塘中筛选出1株高效去除亚硝酸盐菌株，命名为AP3，并进行了该菌株的生理生化指标测定、菌株的亚显微形态观察和16S rDNA基因序列分析；在Oxford Nanopore平台进行AP3全基因组序列测定，采用PCR和qPCR技术对菌株亚硝酸盐去除途径进行初步探讨。结果表明：筛选菌株在初始亚硝酸盐浓度为300 mg/L的培养基中培养4 h后，亚硝酸盐含量低于检测下限；鉴定菌株AP3为贝莱斯芽孢杆菌（Bacillus velezensis）；全基因组测序和KEGG功能注释发现，该菌株亚硝酸盐去除途径中存在NirD和Nark功能基因，并扩增成功；qPCR结果显示，菌株Nark和NirD的基因表达水平在2 h迅速升高，其中，NirD基因表达水平与0 h相比差异极显著（P<0.01）;4 h NirD和Nark基因表达水平与0 h相比，差异不显著。推测菌株AP3的亚硝酸盐去除途径为DNRA。
关键词：贝莱斯芽孢杆菌;亚硝酸盐;全基因组测序;去除途径;基因表达
基金资助：天津市重点研发计划项目（20YFZCSN00140）; 天津市现代农业产业技术体系创新团队（ITTMRS2021009）
