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作者:邓薪瑜;倪龙杰;向鹏;王芝权;於朝广;顾春笋;
单位:南京林业大学林草学院/水土保持学院;江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园);江苏省植物资源研究与利用重点实验室;
摘要:【目的】鉴定海滨木槿AP2/ERF基因家族成员并分析其盐胁迫响应模式,为木槿属植物的耐盐育种提供参考。【方法】使用生物信息学技术对海滨木槿AP2/ERF基因进行全基因组鉴定和分析,基于转录组数据分析和qRT-PCR技术验证HhERF对盐胁迫的响应情况。【结果】(1)在海滨木槿基因组中共鉴定出134个AP2/ERF家族基因成员,命名为HhERF1~HhERF134。(2)理化性质分析结果表明,其蛋白等电点为4.68~10.15,分子质量为1.569~78.511 ku;亚细胞定位预测表明蛋白都位于细胞核。(3)基因结构分析显示,在系统发育树中同一分支上的HhERF基因具有较高的结构相似性。(4)顺式作用元件分析表明,HhERF基因家族成员广泛参与了光响应、植物激素信号转导及非生物逆境胁迫响应。(5)转录组数据和qRT-PCR结果显示,大多数HhERF基因在盐胁迫处理后的特定时间点相对表达量上调,尤其在处理24 h后;其中,HhERF5、HhERF9和HhERF27基因在根部表现出显著的上调。【结论】海滨木槿AP2/ERF基因家族在盐胁迫响应中表现出复杂的时空表达模式,可能通过调控多个生物学过程,如激素信号传导和逆境应答,参与植物的盐胁迫响应。
关键词:海滨木槿;;AP2/ERF基因家族;;盐胁迫;;生物信息学方法;;qRT-PCR
基金资助:江苏省六大人才高峰项目(NY-042);; 江苏省植物资源研究与利用重点实验室开放基金项目(JSPKLB201928);; 江苏省科技项目(XZ-SZ202035)