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作者：陈燕;许强;季洪兵;姜慧敏;李利利;李金松;段招军;
单位：中国疾病预防控制中心(中国预防医学科学院)病毒病预防控制所,传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室,国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室;甘肃中医药大学公共卫生学院;绵阳市安州区疾病预防控制中心;华北理工大学基础医学院,河北省慢性疾病基础医学重点实验室;
摘要：目的 分析中国上市轮状病毒(Rotavirus,RV)疫苗(LLR、LLR3和RotaTeq)接种后疫苗株排毒状况和1株Rotarix疫苗株基因变异情况。方法 在四川省某区采集适龄儿童接种3种RV疫苗后2～3 d的粪便样本，使用胶体金法检测RV抗原，采用逆转录-聚合酶链反应(Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)进行基因扩增和测序确认疫苗株VP7序列;通过RT-PCR、cDNA末端快速扩增技术和一代测序技术获得1株Rotarix疫苗株分离株全基因组，使用基于局部比对算法的搜素工具(Basic local alignment search tool,BLAST)进行基因型鉴定;采用高通量测序检测其VP4基因变异频率。结果 儿童接种LLR、LLR3、RotaTeq后粪便样本RV疫苗株检测阳性率分别为30.0%(9/30)、37.5%(3/8)、64.2%(34/53)。LLR的阳性株均为G10基因型。在LLR3的阳性株中，G2、G3、G4基因型分别为2株、1株、0株。在RotaTeq的阳性株中，G1、G1+G2、G1+G4、G1+G2+G3基因型分别为27株、1株、4株、2株;其中1株分离株为Rotarix疫苗株，全基因组分型为G1-P[8]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1，与原株型相比存在VP1节段的A3287G与C3288T、VP4节段T1418C、VP7节段的C1053T、NSP2节段的A1051T核苷酸变异和VP4节段的I470T氨基酸变异，培养2代后VP4基因的T1418C变异频率由7.22%上升至52.24%。结论 儿童接种3种RV疫苗后均存在一定比例疫苗株排毒，Rotarix疫苗株分离株可能源于粪便污染且存在多个位点变异。需持续监测儿童接种RV疫苗后疫苗株排毒状况并评估其公共卫生影响。
关键词：轮状病毒疫苗;;疫苗株;;排毒;;基因型;;变异
基金资助：北京市自然科学基金-海淀原始创新联合基金(L232011)
