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作者：代涵;申铁;石桃雄;黎瑞源;
单位：贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室;贵州师范大学生命科学学院/荞麦产业技术研究中心;
摘要：利用NCBI数据库中油茶（Camellia oleifera Abel）全基因组序列挖掘SSR位点，并基于Primer 3.0软件设计引物，筛选多态性较高的引物进行遗传多样性的评价。以油茶全基因组序列数据为基础，检测1 661 881个SSR位点，总长为2 889 508 820 bp，发生频率为63.22%。单核苷酸重复类型最多（61.72%），其次为二核苷酸（28.59%）和三核苷酸重复单元（6.90%）。分析重复序列位点发现，油茶SSR中包含337种类型重复基序，主要以A/C为主要重复单元，优势基序依次为A/T(60.46%)、AG/TC(13.88%)、AT/TA(12.09%)、AC/TG(2.86%)、AAT/TTA(2.54%)。在每条染色体上挑选10对引物进行引物合成（共150对），并检测其多态性。结果得出129对引物能扩增出目标条带，其中25对引物能在材料间扩增出特异性条带。利用油茶全基因组序列可实现SSR标记的大规模开发，并可鉴定出适用于油茶遗传多样性分析、遗传图谱构建和品种鉴定等研究的SSR引物。
关键词：油茶;;基因组;;SSR;;种质资源;;遗传多样性
基金资助：贵州师范大学2017年度学术新苗培养及创新探索专项（黔科合平台人才[2017]5726-18）;; 贵州省科技计划项目（黔科合基础[2017]1126）;; 油茶分子设计育种和绿色丰产关键技术创新与应用（黔科合支撑[2022]重点017号）
