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作物杂志2024年第01期:玉米穗粗一般配合力多位点全基因组关联分析和基因组预测

来源:期刊VIP网 时间:


作者:马娟;黄璐;宇婷;郭国俊;朱卫红;刘京宝;

单位:河南省农业科学院粮食作物研究所;

摘要:穗粗是一个重要的穗部性状,一般配合力(GCA)是杂交育种中衡量亲本组配能力的一个重要指标。以NCII遗传交配设计组配的537个F1杂交组合为材料,利用7种多位点全基因组关联分析方法(MGWAS)对河南新乡、周口和综合环境穗粗GCA开展定位分析,并研究MGWAS方法挖掘的显著关联位点作为固定效应对穗粗GCA预测准确性的影响,为穗粗GCA关键位点的基因组选择(GS)育种利用提供指导。结果表明,共检测到18个穗粗GCA显著关联SNP(P<8.52E-07),其中6个位点利用2~5种MGWAS方法同时检测到,3个位点在2个环境中均检测到。5种GS随机效应模型对3个环境穗粗GCA预测准确性均较低,为0.32~0.44。3个环境中,显著位点作为固定效应加入预测模型中均能有效地提高穗粗GCA基因组预测能力,可将预测精度提高到0.38~0.64。

关键词:玉米;;穗粗;;一般配合力;;多位点全基因组关联分析;;基因组选择;;固定效应模型

基金资助:河南省科技攻关项目(222102110043);; 河南省农业科学院优秀青年(2020YQ04)