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中国医学前沿杂志(电子版)2024年第03期:结核分枝杆菌膜囊泡RNA表达谱分析及功能研究

来源:期刊VIP网 时间:


作者:吕翎娜;刘秋月;

单位:首都医科大学附属北京佑安医院肝病消化中心首医基础-临床联合实验室;首都医科大学附属北京胸科医院重症医学科北京市耐药结核病研究重点实验室;

摘要:目的 描绘结核分枝杆菌膜囊泡(mycobacterium tuberculosis membrane vesicles,MVs)的RNA特征表达谱,分析其主要的生物功能,初步探索其诱导巨噬细胞凋亡的作用。方法 分离结核分枝杆菌MVs,提取总RNA,采用illumina Hiseq 2500-SE50平台进行双端测序。使用BWA软件进行序列比对,通过COG数据库对基因进行功能注释。通过MTT试验检测细胞存活率,采用Annexin-V联合PI染色法检测细胞凋亡。结果 本研究通过RNA测序及生物信息学分析描绘了结核分枝杆菌MVs中RNA的种类及含量,COG数据库功能注释结果显示这些RNA主要富集的生物学功能包括脂质转运代谢、氨基酸转运代谢、能量产生与转化、次级代谢物合成转运与代谢和转录等。生物分析显示富集的主要功能包括脂质转运代谢、氨基酸转运代谢、能量产生与转化、次级代谢物合成转运与代谢和转录等。功能实验表明,结核分枝杆菌MVs可以降低THP-1源巨噬细胞的存活率,促进细胞凋亡。结论 结核分枝杆菌MVs中含有丰富的短片段RNA,具有诱发细胞凋亡的作用。然而其具体作用机制仍需要更深入细致的研究。

关键词:结核分枝杆菌;;膜囊泡;;核糖核酸测序;;细胞凋亡

基金资助:国家自然科学基金(82372260,82100011);; 北京市自然科学基金海淀原始创新联合项目(L202023)~~