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作者：沈忠杰;张俊勇;葛成国;
单位：重庆医科大学附属第二医院泌尿外科;
摘要：目的 通过生物信息学方法构建并验证泌尿系肿瘤铁死亡相关的预后模型。方法 分析TCGA中的膀胱癌(BLCA)和肾透明细胞癌(KIRC)数据集的RNA-seq及临床数据，建立预后模型，并使用ICGC和GEO数据进行验证。通过单变量Cox、LASSO-Cox和多变量Cox回归分析确定铁死亡相关预后基因。利用共表达和蛋白-蛋白互作网络分析基因间的关系，以及通过免疫浸润分析探讨基因与免疫微环境的关联。对BLCA和KIRC预后模型高低风险组的差异表达基因进行功能富集分析，探讨铁死亡相关基因调控这两种癌症预后的潜在机制。结果 在BLCA和KIRC中鉴定出与预后显著相关的铁死亡基因，包括BLCA的EGR1、ZEB1、P4HB、WWTR1、JUN、CDO1、SCD、SREBF1、CAV1、GALNT14等；KIRC的ASMTL-AS1、CHAC1、MT1G、RRM2、TIMP1、DPEP1、GLRX5、NDRG1等。此外，筛选出与两种癌症预后相关的铁死亡相关miRNA。基于这些基因和miRNA构建的风险模型预测了TCGA-BLCA和KIRC患者的预后，其中低危组的总生存期显著高于高危组(P<0.05),模型的风险比范围为2.54(95%CI:1.73～3.74)至4.74(95%CI:3.47～6.47),AUC均在0.60以上。共表达分析和蛋白-蛋白互作网络显示BLAC中JUN与EGR1表达水平相关性高，SCD与SREBF1之间也存在相关性。免疫浸润相关性分析显示BLCA中EGR1、CAV1、JUN基因表达与免疫评分呈正相关，SREBF1与免疫评分呈负相关。结论 基于铁死亡相关基因的预后模型在预测BLCA和KIRC患者预后方面表现出良好的性能，可为靶向铁死亡评估BLCA和KIRC患者预后提供参考。
关键词：膀胱尿路上皮癌;肾透明细胞癌;铁死亡;预后模型;miRNAs;免疫浸润
基金资助：重庆市自然科学基金(编号：CSTB2022NSCQ-MSX0879)~~
