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作者:孙梦璘;吴楠;张泽明;姚红玉;吴弘;赵大鹏;
单位:天津师范大学生命科学学院;
摘要:为了探究鹤类动物肠道菌群结构的组成特点及其与宿主健康水平的关系,以动物园圈养生境下的灰鹤(Grus grus)、灰冕鹤(Balearica regulorum)和蓑羽鹤(Grus virgo)为研究对象,采用非损伤取样法采集粪便样本,利用16S rRNA高通量测序技术分析比较这3个鹤类物种的肠道菌群结构组成差异.结果显示:(1) 3个物种的共有优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteriota)和变形菌门(Proteobacteria),共有优势菌属为乳杆菌属(Lactobacillus),肠道菌群结构组成在门水平和属水平上均存在显著的物种间差异;(2)灰鹤样本组肠道菌群的多样性与丰富度均高于灰冕鹤和蓑羽鹤样本组的数值;(3)基于KEGG数据库对肠道菌群功能预测结果显示,灰鹤样本组的全局和总览、能量代谢、氨基酸代谢、辅助因子和维生素代谢的相对丰度均高于灰冕鹤和蓑羽鹤样本组的数值;(4)对潜在致病菌进行初步预测,发现致病菌相对丰度占比位居前3位的菌门分别是变形菌门、厚壁菌门和髌骨细菌门,致病菌相对丰度占比位居前3位的菌属分别是葡萄球菌属(Staphylococcus)、中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)和原囊菌属(Archangium).
关键词:鹤科;;肠道菌群;;种间差异;;高通量测序技术
基金资助:中央财政林业补助资金项目-野生动物监测专项;; 生态环境部生物多样性调查、观测与评估项目;; 国家自然科学基金资助项目(31772468)