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河南农业大学学报2024年第02期:甜瓜果形基因CmSUN25-26-27a的鉴定和分子标记

来源:期刊VIP网 时间:


作者:郑静文;曹晨晨;曹磊;李文龙;王盼乔;李翔;胡建斌;

单位:河南农业大学园艺学院;河南省瓜类种质资源创新与利用工程技术研究中心;

摘要:【目的】挖掘甜瓜果形相关基因,为甜瓜果实形状的遗传改良提供理论基础。【方法】通过全基因组鉴定,系统发育分析,结合表达量与果形的关联分析来鉴定参与甜瓜果形调控的CmSUN基因,并利用候选基因在自然群体中的序列变异开发相关分子标记。【结果】通过全基因组鉴定及系统发育分析,鉴定到甜瓜CmSUN家族的CmSUN25-26-27a基因。该基因在开花当天的雌花中有显著的表达,并且在不同果形甜瓜中的表达量与果形指数(fruit shape index,FSI)呈正相关关系;对200份自然群体的序列分析发现,CmSUN25-26-27a基因编码区存在一个SNP-Single Nucleotide Polymorphism(A/G),导致了编码氨基酸的非同义突变,含有CmSUN25-26-27a A等位基因的厚皮甜瓜的FSI显著高于含CmSUN25-26-27a G等位基因的厚皮种质。该SNP位点将厚皮甜瓜按果形大致分为FSI>1.5(A)和FSI <1.5(G)两种类型。根据该SNP位点设计了用于区分甜瓜果形的dCAPS标记。【结论】CmSUN25-26-27a同源基因广泛参与葫芦科作物的果形调控,该基因在甜瓜中的表达量及序列变异与甜瓜FSI具有显著相关性。

关键词:甜瓜;;CmSUN基因家族;;CmSUN25-26-27a基因;;果实形状;;分子标记

基金资助:河南省农业良种联合攻关项目(2022010503);; 河南农业大学青年英才项目(30501340)