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作者:刘杨;田真;何新媛;樊祥宇;
单位:济南大学信息科学与工程学院;聊城市人民医院转化医学研究联合实验室;济南大学生物科学与技术学院;
摘要:针对病毒-宿主关联数据库不完善以及现有病毒-宿主关联预测方法的局限性,全面综述当前应用于该领域的主要预测方法,包括基于序列比对的方法、基于特征相似的方法、基于机器学习的方法和集成方法;根据每种方法所依据的技术原理,全面分析不同方法在预测性能、计算资源等方面的优势和劣势。针对现有研究的状况,指出未来的研究重点应聚焦于构建更加全面的病毒-宿主关联样本库,并运用表征学习、多模态学习等方法,同时在建模过程中应关注预测结果的可解释性。
关键词:生物信息学;;病毒-宿主关联预测;;序列比对;;表征学习;;多模态学习
基金资助:山东省自然科学基金项目(ZR2021MC018);; 山东省科技型中小企业创新能力提升工程项目(2022TSGC2305)