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疾病监测2024年第01期:2019-2021年安徽省外环境H9N2亚型禽流感病毒分子进化分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:黄鑫儿;周雪;杨思天;胡敏昊;俞峻岭;罗婉蓉;方惟希;何军;

单位:安徽医科大学公共卫生学院;安徽省疾病预防控制中心;安徽省公共卫生研究院;

摘要:目的 分析安徽省2019—2021年外环境监测中H9N2亚型禽流感病毒的遗传进化特征。方法 选取禽流感外环境病原学监测H9N2亚型禽流感病毒阳性样本383份,使用鸡胚分离培养收获21株病毒,采用实时荧光定量PCR方法扩增后进行全基因组测序,用生物信息学软件构建基因进化树分析其遗传进化特征。结果 21株H9N2亚型禽流感病毒均为G57基因型,血凝素(HA)基因片段属于JN/99基因型,神经氨酸酶(NA)基因属于G9基因型,基质蛋白(MP)基因属于G1基因型,内部核蛋白(NP)、非结构蛋白(NS)、酸性聚合酶蛋白(PA)、碱性聚合酶蛋白1(PB1)基因属于F/98基因型,碱性聚合酶蛋白2(PB2)基因片段属于ST/7 488基因型毒株。HA裂解位点显示低致病性分子特征,存在重要氨基酸位点突变,HA蛋白发生了Q226L、H183N、T189D、A190T氨基酸突变;NA蛋白茎部均发生了62~64位点缺失;大部分毒株未发生PB2-E627K突变,所有毒株均未发生D701N突变;所有毒株PA蛋白具有356R和409N氨基酸突变,M2蛋白均发生S31N氨基酸突变。结论 2019—2021年安徽省外环境分离得到的H9N2亚型禽流感病毒为多源重配病毒,且具有逐渐适应哺乳动物宿主相关的分子特征,需密切关注病毒的病原学演化。

关键词:H9N2亚型;;禽流感;;遗传特征;;分子特征

基金资助:2021年度安徽省卫生健康科研项目(No.AHWJ2021a030);; 科技部国家重点研发计划政府间国际科技创新合作项目(No.2022YFE0110100);; 浙江大学医学院附属第一医院传染病诊治国家重点实验室开放基金资助项目(No.SKLID2021KF04);; 2022年安徽省新冠病毒科研应急攻关项目(No.2022e07020071)~~