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作者：杨淑柳;向煜;王泉;武娅宁;肖开提·米吉提;王瑞欢;高晓平;赵秀芹;李马超;王冕;万康林;李桂莲;刘海灿;袁秀琴;
单位：南华大学公共卫生学院;传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所;新疆医科大学第八附属医院;
摘要：目的 比较不同家系及耐药性结核分枝杆菌临床分离株ESX-4分泌系统7个毒力基因突变的差异，探讨临床菌株中ESX-4基因的多态性特征。方法 纳入新疆维吾尔自治区南疆地区807株结核分枝杆菌临床株，进行全基因组测序。利用TBprofiler软件及C++脚本程序检测不同临床菌株ESX-4基因的突变、家系和药物敏感性结果。对数据进行描述性分析、χ~2检验及logistics回归分析。结果 在807株结核分枝杆菌中共发现119个单核苷酸多态性位点和12种不同的插入/缺失。非同义突变率排在前3位的基因是Rv3446c(43.12%)、esx U(40.02%)以及ecc C4和ecc D4基因（均为23.30%）。家系中Lineage 2(L2)占62.70%(506/807),L3占19.46%(157/807),L4占17.84%(144/807)；敏感株占39.41%(318/807)，耐药株占60.59%(489/807)；利福平耐药占34.08%(275/807)，异烟肼耐药占28.50%(230/807)，喹诺酮类耐药占12.14%(98/807)。L3家系中eccC4和esxT基因的突变率均显著高于L2或L4家系。多因素logistics回归模型分析发现：L2家系和异烟肼耐药是esxU和Rv3446c基因发生突变的危险因素[均比值比（OR）>1，均P<0.001]；多耐药则是Rv3446c突变的又一危险因素[OR=1.94,95%置信区间（CI）:1.12～3.37]。结论 本研究发现了结核分枝杆菌ESX-4分泌系统中与L2、L3家系及耐药性相关的基因突变，为进一步研究结核分枝杆菌的传播、耐药和致病机制提供基础科学依据。
关键词：结核分枝杆菌;;ESX-4分泌系统;;毒力基因;;突变;;基因多态性
基金资助：北京市自然科学基金面上项目（No.7242189）;; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所项目（No.0104327;33066;33077）;; 新疆科技重大专项（No.2017A03006-3）;; “十三五”国家科技重大专项（No.2018ZX10103001-003-012）~~
