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作者:胡欣贵;赵杰银;陆佳欣;陈全家;曲延英;
单位:新疆农业大学农学院/教育部棉花工程研究中心;
摘要:R2R3-MYB转录因子在植物响应胁迫过程中发挥着重要作用。本研究基于海岛棉基因组数据,系统鉴定了海岛棉R2R3-MYB基因家族成员,利用生物信息学方法对海岛棉R2R3-MYB家族基因进行了系统进化、结构、理化性质和启动子顺式作用元件分析,利用转录组表达谱筛选出5个抗黄萎病候选基因,并通过实时荧光定量PCR对各候选基因在黄萎病、水杨酸(SA)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导下的表达规律进行分析。结果显示,海岛棉基因组中包含98个R2R3-MYB基因,分布于25条染色体上;进化树结果表明,在海岛棉中R2R3-MYB基因家族成员可分成3个亚组,在进化上相对保守;启动子分析发现多个响应植物激素和胁迫相关的顺式作用元件;黄萎病胁迫后的表达模式分析发现,海岛棉R2R3-MYB基因在黄萎病胁迫后均存在不同程度的差异表达,筛选得到5个海岛棉抗黄萎病候选基因(GbMYB-21、GbMYB-34、GbMYB-39、GbMYB-76和GbMYB-83),它们均受到黄萎病胁迫以及SA和MeJA诱导表达。总之,本研究表明海岛棉R2R3-MYB基因家族在棉花抗病方面具有重要作用,该结论可为进一步研究海岛棉R2R3-MYB基因功能和棉花抗黄萎病的分子机制提供理论依据。
关键词:海岛棉;;R2R3-MYB基因家族;;生物信息学分析;;黄萎病胁迫;;表达分析
基金资助:新疆维吾尔自治区重大科技专项“早熟抗病棉花新品种设计与培育”(2023ZD04041);; 新疆“天山英才”培养计划项目(2023TSYCLJ0012)