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中国草地学报2025年第06期:盐胁迫下老芒麦叶片转录组SSR位点信息分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:李德珍;德英;穆怀彬;闫伟红;胡哲华;

单位:中国农业科学院草原研究所;四子王旗草原工作站;

摘要:老芒麦是退化草地生态治理和草牧业中广泛应用的优良草种。本研究以中草28号老芒麦为研究对象,在250 mmol/L NaCl盐溶液胁迫0、2、4、6、12 h时取叶片进行转录组测序分析。结果表明,共获得149556条Unigenes序列,总序列长为130384898 bp;SSR位点信息分析显示,13299条Unigenes序列中含有16446个2~6个碱基的SSR重复序列,平均距离7928 bp,SSR的发生频率为8.89%,出现频率为11.00%。其中:三核苷酸重复SSRs序列是最主要的类型,占比55.22%,出现频率为6.07%;其次是二核苷酸重复SSRs序列,占比25.21%,出现频率为2.77%。SSRs基元的重复次数主要集中在4~7次,占比85.65%。SSRs位点包含279种重复基元,其中CCG/CGG重复基元数量最多,占总数的18.78%;其次是AG/CT重复基元,占总数的15.10%。重复序列长度≥20 bp的SSRs位点有5688个,占总数的34.59%。综上,盐胁迫下老芒麦叶片转录组中SSR位点表现出较高的多样性和多态性潜能,为老芒麦的遗传多样性研究、分子标记辅助育种提供了重要的标记资源。

关键词:盐胁迫;;老芒麦叶片;;转录组;;SSR位点信息

基金资助:国家重点研发计划项目(SQ2023YFD1200073);; 内蒙古科技重大专项(2021ZD0031);; 国家自然科学基金项目(31802121)