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作者:陈明辉;徐豫;黄志强;王俊青;张保青;
单位:平顶山学院化学与环境工程学院/河南省生态经济型木本植物种质创新与利用重点实验室;平顶山市林业局;广西甘蔗遗传改良重点实验室/广西农业科学院甘蔗研究所/农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室;
摘要:探讨冷胁迫(0℃)条件下果蔗基因表达谱的变化,为果蔗抗寒育种、引种及栽培提供理论依据。采用高通量测序平台对对照组(25℃)和冷胁迫处理组(0℃)条件下果蔗进行转录组测序。对测序数据进行分析,筛选响应冷胁迫的茉莉酸代谢途径关键基因,对鉴定出的重要基因进行表达量的qRT-PCR验证。结果表明,低温胁迫处理后,2组样品通过筛选共获得321个差异表达基因(DEGs),其中167个基因上调,154个基因下调。GO功能富集分析显示,DEGs显著富集于催化活性、结合、代谢过程、细胞过程和细胞器等条目。KEGG途径富集分析发现,角质和木栓质合成、光合作用、脂肪酸代谢、淀粉和蔗糖代谢以及植物激素信号转导等为果蔗响应冷胁迫的重要代谢通路。qRT-PCR分析表明,冷胁迫后果蔗茉莉酸代谢途径相关基因SoPYL1、SoOPCL1、SoAOC1、SoLOX3、SoAOS1和SoMYC2均上调表达,该结果与转录组测序变化趋势相似,同时进一步证实了RNA-seq数据的准确性。
关键词:果蔗;;转录组测序;;冷胁迫;;茉莉酸代谢途径
基金资助:河南省科技厅科技攻关计划项目(222102110448);; 河南省中原学者工作站(ZYGZZ2021048);; 广西甘蔗遗传改良重点实验室开放性研究项目(19-185-24-K-01-01,21-238-16-A-01-02);; 中国科学院华南植物园重点支持项目(E36101)