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作者：樊瑞芳;代小伟;杨新宇;陈双双;陈昊;于兰;赵琰枫;李传友;王嫩寒;
单位：北京市疾病预防控制中心结核病实验室;
摘要：目的:研究荧光PCR探针熔解曲线技术(简称“熔解曲线法”)和DNA微阵列芯片技术(简称“基因芯片法”)在分枝杆菌菌种鉴定方面的临床应用价值。方法:选取熔解曲线法和基因芯片法检测范围内的分枝杆菌标准菌株，以及2016年1月至2023年8月北京市疾病预防控制中心结核病实验室保存的疑似非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacterium, NTM)的临床分离菌株，采用2种方法进行检测分析，对检测异常的菌株进行全基因组测序分析。结果:共选取19种分枝杆菌标准菌株，每种各1株；采用熔解曲线法和基因芯片法对标准菌株进行检测，符合率均为100.00%;收集到临床分离菌株180株，经熔解曲线法和基因芯片法鉴定为结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex, MTB)的菌株8株，1株MTB合并偶发分枝杆菌，NTM菌株171株。2种方法检测临床分离菌株的一致率为87.78%(158/180);检测一致的149株NTM菌株中，占比前4位的依次为鸟分枝杆菌复合群(MAC)[38.26%(57/149)]、龟分枝杆菌或脓肿分枝杆菌[24.83%(37/149)]、堪萨斯分枝杆菌[17.45%(26/149)]、偶发分枝杆菌[12.75%(19/149)]。2种方法鉴定结果不同的菌株22株，9株为MAC;1株基因芯片法鉴定为胞内分枝杆菌，熔解曲线法鉴定为慢生黄分枝杆菌；1株基因芯片法鉴定为土分枝杆菌，熔解曲线法鉴定为不产色分枝杆菌。10株基因芯片法有菌种鉴定结果，熔解曲线法无法判读；1株基因芯片法无法判读，熔解曲线法判读为慢生黄分枝杆菌。采用全基因组测序计算平均核苷酸一致性(average nucleotide identity, ANI),检测出爱知戈登氏菌(ANI=99.102)、沃林斯基分枝杆菌(ANI=97.822)、慕里黑分枝杆菌(ANI=97.365)、外来分枝杆菌(ANI=97.730/97.981/96.930)、大口非鲫分枝杆菌(ANI=96.277)。结论:熔解曲线法和基因芯片法在分枝杆菌菌种鉴定方面均具有较好的临床应用价值，且熔解曲线法鉴定结果准确度更高。
关键词：分枝杆菌感染;;分枝杆菌,结核;;分子探针技术;;诊断,鉴别
基金资助：北京市疾病预防控制中心科研培育专项(2023-KYJH-04)~~
