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作者:陈大伟;李兵兵;孙敏;刘靓;魏明月;李洁;阴万利;杨鹏飞;
单位:淮安市疾病预防控制中心,江苏省食品安全风险监测重点实验室(致病菌);
摘要:旨在预测分析生畜肉源沙门菌前噬菌体的携带情况和分布特征,鉴定前噬菌体携带的耐药基因和毒力基因,提示沙门菌中前噬菌体的功能。利用Phaster在线工具预测沙门菌的前噬菌体携带情况,利用Cards数据库和Vfdb数据库进行耐药基因和毒力基因的预测分析,利用丝裂霉素C诱导前噬菌体。结果:101株沙门菌共预测出645条前噬菌体片段,其中完整型前噬菌体392条、不完整型前噬菌体152条、可疑型前噬菌体101条,平均每株菌携带3.9条完整型前噬菌体;前噬菌体基因组占宿主菌基因组的百分比主要集中在2%~4%,大小以20~40 kb为主。5条前噬菌体携带24个耐药基因,可分为9类,预测产生5种耐药机制。192条前噬菌体共编码256个毒力基因,归类为16种毒力因子,完整型前噬菌体平均每条携带3个毒力基因。肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌前噬菌体可被诱导出。综上,前噬菌体在生畜肉源沙门菌中分布广泛且以完整型为主,携带毒力基因多,耐药基因少,可能对沙门菌毒力具有重要影响。
关键词:沙门菌;;前噬菌体;;基因组学;;耐药基因;;毒力基因
基金资助:江苏省卫生健康委员会科研项目(Ym2023085)