我们的服务符合学术规范和道德
专业 高端让您使用时没有后顾之忧

天津师范大学学报(自然科学版)2025年第03期:基于铁死亡对葛花作用于MAPK3干预肝癌的机制研究

来源:期刊VIP网 时间:


作者:李军;周毅雪;张楠楠;楼迪栋;

单位:贵州中医药大学基础医学院;

摘要:为了解葛花通过诱导铁死亡干预肝癌的作用及机制,利用GeneCards等数据库筛选肝癌靶点,从FerrDb数据库下载得到铁死亡靶点,通过TCMSP数据库获取葛花靶点,使用R语言获取肝癌-铁死亡-葛花三者交集靶点.借助String数据库、Cytoscape3.9.1软件构建蛋白-蛋白相互作用网络图(PPI),同时用CytoHubba插件以及R语言筛选得到Hub genes.利用David数据库及微生信对关键作用靶点进行GO和KEGG分析.为进一步筛选关键靶点,对Hub genes进行差异表达分析、蛋白质图谱分析、临床相关性分析以及生存分析.将筛选的Hub genes通过分子对接和分子动力学模拟进行进一步验证,采用Western blot实验进行体外实验验证.共得到肝癌疾病靶点5 859个、铁死亡基因485个、葛花靶点526个、交集靶点66个.筛选得到Hub genes 17个. GO功能分析筛选P值最小的前5个生物过程、细胞组分、分子功能;KEGG富集分析筛选出多条通路.差异表达分析、临床相关性分析、生存分析结果显示,SRC和MAPK3基因在肝癌中的表达显著高于正常组中的表达.分子对接和分子动力学模拟分析结果显示,MAPK3与葛花活性成分染料木黄酮(genistein)具有较好的结合力. Western blot实验表明,葛花使PMAPK3的表达明显降低(P <0.05).上述结果表明,葛花可通过作用于MAPK3调控铁死亡从而干预肝癌.

关键词:葛花;;肝癌;;铁死亡;;MAPK3;;genistein

基金资助:贵州省基础研究计划项目(黔科合基础-ZK[2024]一般382);; 2023年贵州中医药大学研究生教育创新计划项目(YCXKYB2023001);; 国家自然科学基金资助项目(8246140824)