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疾病监测2025年第08期:基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术念珠状链杆菌自建库的构建及验证

来源:期刊VIP网 时间:


作者:陈映;王会玉;王琼瑛;王丽华;李洪;王宇萌;

单位:海南省琼海市人民医院;中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室;

摘要:目的 本研究旨在基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术,构建念珠状链杆菌的特异性鉴定数据库,以解决现有质谱数据库在同属菌种鉴别中将非目标菌株误判为念珠状链杆菌的问题,从而提高临床和实验室对该菌种的准确鉴定能力。方法 收集2019—2024年从临床血液样本分离的17株念珠状链杆菌和1株澳洲弹鼠链杆菌。首先用16S rRNA基因测序的方法鉴定上述18株菌,然后分别用全自动微生物鉴定仪(Vitek-2 Compact)和全自动微生物质谱鉴定系统(Vitek-MS)对这些菌株分别进行鉴定。选取10株念珠状链杆菌,使用Vitek-MS科研数据库采集靶点,通过SARAMIS 4.17软件构建念珠状链杆菌图谱库;剩余7株念珠状链杆菌和1株澳洲弹鼠链杆菌用于验证自建库;选用不同品牌公司的质谱系统分别对澳洲弹鼠链杆菌进行鉴定,验证不同品牌公司质谱鉴定数据库是否能区分念珠状链杆菌和澳洲弹鼠链杆菌;用16S rRNA基因序列比较18株链杆菌的聚类种系发生关系,与自建库对18株菌的聚类分析结果作比较,验证自建库的准确性。结果 17株念珠状链杆菌和1株澳洲弹鼠链杆菌经16S rRNA测序得到鉴定结果。Vitek-2 Compact和Vitek-MS(建库前)对这18株菌均未见鉴定结果。本研究使用10株念珠状链杆菌建库成功,经验证,Vitek-MS自建库可准确识别7株念珠状链杆菌,置信度为99.90%,澳洲弹鼠链杆菌在念珠状链杆菌自建库上未见鉴定结果。其他品牌质谱数据库均把澳洲弹鼠链杆菌错误鉴定为念珠状链杆菌,种或属水平可信。自建库质谱聚类与16S rRNA基因序列聚类结果一致。结论 本研究基于Vitek-MS系统成功构建了念珠状链杆菌质谱自建库,初步验证表明该自建库能够有效区分念珠状链杆菌与相近菌种,显著提升了鉴定准确性。然而,受限于当前纳入的菌株数量和来源,该鉴定库的性能仍需通过增加更多菌株来进一步验证和完善。

关键词:念珠状链杆菌;;澳洲弹鼠链杆菌;;基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱;;自建库;;聚类分析

基金资助:国家重点研发计划(No.2024YFC2310100);; 传染病监测防治技术能力提升(No.102393240020020000003)~~