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疾病监测2025年第09期:从海南省三亚地区4例类鼻疽复发患者分离的类鼻疽伯克霍尔德菌菌株基因组特征比较

来源:期刊VIP网 时间:


作者:符晓莹;钟山;李欢;黎元莉;王立程;王崇圳;许丽霞;朱雄;

单位:三亚市人民医院;

摘要:目的 通过对分离自2012—2023年海南省三亚地区4例类鼻疽复发患者的类鼻疽伯克霍尔德菌菌株基因组特征比较,探讨病例复发类型和菌株变化特点。方法 本研究纳入从4例类鼻疽复发患者先后两次分离的8株菌株,对其进行全基因组测序和组装,使用相应的软件、网站或数据库进行基因组比对、单核苷酸多态性(SNP)检测、多位点序列分型分析、蛋白质组差异分析、毒力因子和耐药基因鉴定,并进行体外药敏试验。结果 4组菌株的分型均无变化,平均SNP变化率分别为23.24、69.01、77.59和18.80 SNPs/基因组/年;每组菌株共享相似的蛋白质组和毒力基因,菌株独有的蛋白质簇不超过1个,毒力基因差异1~4个;耐药基因和体外药敏试验未发现变化。结论 4例类鼻疽复发患者极有可能均是初发菌株引起的复发,菌株变化特点可能与菌株在宿主体内的适应性有关。

关键词:类鼻疽;;复发;;全基因组测序;;单核苷酸多态性

基金资助:海南省自然科学基金青年基金项目(No.820QN428);; 海南省院士团队创新中心资金联合资助~~