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作者:苏五珍;李中波;刘伟;
单位:怀化职业技术学院动物科技学院;龙岩学院生命科学学院;动物源性人兽共患病防控福建省高校工程研究中心;湖南农业大学动物医学院;
摘要:为探究湖南省中部和西部地区山羊源肝片吸虫的遗传多样性,分析其核糖体、线粒体基因序列特征,并阐明虫株之间的遗传进化关系,本试验以分离于湖南省张家界、湘西、怀化、邵阳、永州和娄底地区的36株山羊源肝片吸虫为样品,对其18S核糖体RNA(18S rRNA)、内转录间隔Ⅰ区(ITS-1)、内转录间隔Ⅱ区(ITS-2)、线粒体细胞色素C氧化酶I亚基(cox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶I亚基(nad1)基因进行PCR扩增和测序,以分析5个基因的序列特征及其种内和种间差异,绘制遗传进化树以阐明其遗传进化关系。结果显示,肝片吸虫的18S rRNA、ITS-1、ITS-2、cox1和nad1基因序列长度分别为585、453、360、676和903 bp;其中,肝片吸虫18S rRNA、ITS-1基因序列呈碱基GC偏好,而ITS-2、cox1和nad1基因序列却呈碱基AT偏好;肝片吸虫18S rRNA、ITS-1、ITS-2、cox1和nad1基因的种内差异分别为0~1.0%、0~2.0%、0~0.3%、0~2.7%和0~1.7%,种间差异分别为0.68%~1.85%、0.44%~3.52%、1.11%~9.44%、1.48%~13.46%和8.31%~14.51%;遗传进化分析发现,来源于湖南省张家界、吉首、怀化、邵阳、永州和娄底地区的36株山羊源肝片吸虫均聚类在同一分支。结果表明,湖南省中部和西部地区山羊源肝片吸虫个体之间虽存在低程度的遗传多样性,但具有较近的亲缘关系,且ITS-2和nad1基因可作为片形吸虫种间研究的遗传标记。
关键词:肝片吸虫;;序列特征;;种内差异;;种间差异;;遗传进化关系
基金资助:湖南省怀化市科技局项目(2023R2208);; 湖南省教育厅优秀青年项目(23B1072);; 湖南省自然科学基金项目(2022JJ50319);; 动物源性人兽共患病防控福建省高校工程研究中心项目(2022K004)