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中国草地学报2026年第02期:紫花苜蓿线粒体基因组结构与特征分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:李含笑;马兰民;杨卜玮;朱婷婷;徐雯敏;蒋中玉;马乐乐;李萍;

单位:青海大学生态环境工程学院;

摘要:线粒体基因组(Mitochondrial genome, mtDNA)对紫花苜蓿的遗传改良至关重要。本研究采用改良CTAB法从紫花苜蓿(品系为青大1号)叶中提取线粒体DNA并测序,结果表明青大1号紫花苜蓿mtDNA全长290 285 bp,包含35个蛋白质编码基因、15个tRNA和3个rRNA基因;鉴定出56个简单重复序列和48个长片段重复序列;多数蛋白编码基因受纯化选择(Ka/Ks<1),仅rps1和nad9基因(Ka/Ks>1)呈适应性进化;IR边界分析显示,其基因组较大豆等豆科植物更紧凑,SSR以四核苷酸重复为主;进化分析显示,其与蒺藜苜蓿亲缘关系最近;密码子偏好性分析表明,其偏好A/U结尾的密码子,中性绘图和ENC-plot显示自然选择对其偏好性影响较大。

关键词:紫花苜蓿;;线粒体基因组;;特征分析;;系统发育分析;;密码子偏好性

基金资助:青海大学教学名师培育计划项目;; 中央财政林草科技推广示范项目[青(2023)TG03]