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作者：樊国建;熊硕;汪晴;李小秀;刘芊;吕启明;袁定阳;段美娟;
单位：水稻逆境生物学湖南省重点实验室/湖南农业大学农学院;湖南杂交水稻研究中心/杂交水稻全国重点实验室;中国农业大学农学院;湖南大学生物学院隆平分院;湖南女子学院;
摘要：水稻镉离子转运蛋白OsHMA3对水稻籽粒镉积累具有重要影响,其序列变异是造成籼粳稻籽粒镉含量差异的主要因素,但目前还缺乏对OsHMA3基因在水稻中序列变异的系统性分析。利用水稻核心种质资源的第3代测序数据,对OsHMA3基因进行了系统性分析。结果表明,OsHMA3基因在少数材料中存在拷贝数变异,在部分野生稻材料中存在移码突变;OsHMA3基因在籼稻与粳稻之间存在明显分化,而启动子区域的变异是影响籼粳稻籽粒镉积累差异的主要原因。启动子-683～-557 bp区域存在7个SNPs,不同单倍型的OsHMA3表达量存在显著差异,其中-576 bp位点对基因表达量无显著影响,表明该区域的其他6个自然变异位点是导致籼粳稻籽粒镉积累差异的关键位点。利用OsHMA3的粳稻优势单倍型对低镉籼稻育种具有重要指导意义。
关键词：水稻;;OsHMA3基因;;单倍型;;低镉
基金资助：湖南省重大科技攻关项目(2022NK1010);; 湖南省农业科技创新资金项目(2024CX76);; 湖南省自然科学基金项目(2024JJ6334);; 长沙市科技计划项目(kq2404007)
