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作物杂志2024年第04期:甜菜C_2H_2型锌指蛋白转录因子家族全基因组鉴定及镉胁迫下的表达分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:姚琦;王皓;徐翎清;兴旺;刘大丽;鲁振强;

单位:黑龙江省寒区植物基因与生物发酵重点实验室/黑龙江大学生命科学学院;国家甜菜种质中期库/黑龙江大学现代农业与生态环境学院;黑龙江大学省高校甜菜遗传育种重点实验室/现代农业与生态环境学院;

摘要:甜菜作为一类新兴的能源作物,在重金属污染土壤的修复中具有潜在的优势。探究镉胁迫下甜菜的应答机制,对于培育耐重金属胁迫的甜菜新种质以及生态修复具有重大意义。锌指蛋白转录因子(zinc-finger protein transcription factor)是植物中广泛存在的基因家族,全方面参与植物的生长发育,并响应生物和非生物胁迫。本研究通过全基因组鉴定以及理化性质、基因结构、保守基序、染色体定位和顺式作用元件分析发现,甜菜体内共有32个C_2H_2型锌指蛋白转录因子家族成员,可分为3个亚族,各成员具有数量不等的锌指结构域且不同亚族成员的基因结构及序列特征存在较大差异。通过对镉胁迫下的甜菜C_2H_2型锌指蛋白转录因子的表达和差异表达基因的调控网络分析发现,BVRB_6g137660、BVRB_8g189640、BVRB_1g000840和BVRB_007840在镉胁迫下表达量均不同程度上调,且可能调控了镉胁迫下甜菜金属耐受蛋白及ABC转运蛋白等重要基因的表达,推测这些转录因子在提高甜菜镉耐受性方面起到了关键作用。

关键词:甜菜;;锌指蛋白;;镉胁迫;;转录因子

基金资助:黑龙江省自然科学基金(LH2019C057);; 国家糖料产业技术体系项目(CARS-170102);; 黑龙江省教育厅基本科研业务费(2022-KYYWF-1070)