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作物杂志2024年第02期:苦荞FtERF基因克隆、生物信息学及其表达分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:张俊;蔡苏云;徐子豪;侯蕾;贺润丽;尹桂芳;王莉花;王艳青;卢文洁;孙道旺;

单位:山西中医药大学中药与食品工程学院;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室;

摘要:乙烯响应因子对植物发育和细胞代谢具有重要作用。通过RT-PCR从苦荞中克隆出ERF基因,对其进行生物信息学分析和差异表达分析。结果表明,FtERF基因开放阅读框长度为729 bp,编码了243个氨基酸,编码的蛋白分子量26.08 k D,等电点9.22,属于亲水性蛋白。FtERF不含有信号肽和跨膜螺旋结构,亚细胞定位在细胞核内,蛋白质二级结构和三级结构高度相似。FtERF含有抑制基序DLNxxP,系统进化表明FtERF和ERF4关系较近。经荧光定量表达发现,厚壳苦荞不同部位表达均高于薄壳苦荞,苦荞发育成熟期表达高于非成熟期。

关键词:苦荞;;乙烯响应因子;;生物信息学;;表达分析

基金资助:国家自然科学基金(31460379);; 财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系(CARS-07-C-2);; 山西省重点研发计划(201803D221012-6);; 山西省自然科学研究面上项目(20210302123231)