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东北农业大学学报2024年第08期:番茄DUF247基因家族全基因组鉴定

来源:期刊VIP网 时间:


作者:王傲雪;白怡潇;田雨鑫;张慧欣;刘树森;刘钊;

单位:东北农业大学园艺园林学院;东北农业大学生命科学学院;山东省寿光市三木种苗有限公司;

摘要:DUF247是一个保守的蛋白质结构域,编码含有此结构域的蛋白质在植物生长、发育及胁迫中发挥重要作用。研究鉴定了番茄基因组中26个DUF247基因家族成员,分别命名为SlDUF247-1~SlDUF247-26。对DUF247基因家族理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、系统进化关系、启动子顺式作用元件等进行生物信息学分析。结果表明:染色体分布说明番茄DUF247基因家族在结构和功能具有多样性。启动子顺式作用元件分析显示,番茄DUF247基因家族成员,可能参与非生物胁迫和植物生长发育等多种生物学过程。转录组数据显示,20个番茄DUF247家族成员能够抵抗干旱和冷胁迫。结果有助于揭示DUF247基因家族在番茄生长发育和逆境中的基因功能。

关键词:DUF247基因家族;;番茄;;生物信息学;;基因功能

基金资助:国家自然科学基金面上项目(32072588);; 泰山产业领军人才工程项目