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畜牧与兽医2024年第07期:草鱼MHCⅠα基因克隆及其多态性特征分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:戴薇;汤井雪;陈俊红;朱瑾雯;戴鼎震;

单位:金陵科技学院动物科学与食品工程学院,南京市动物生物技术创新实验室;

摘要:主要组织相容性复合体(MHC)是存在于脊椎动物染色体上、呈高度多态性的基因群,与机体的抗病性密切关系。MHCⅠ类分子由α链和β_(2m)微球蛋白组成,α链呈高度多态性。为探究草鱼MHCⅠα基因的多态性特征,本研究对3个草鱼个体的MHCⅠα基因进行克隆和测序,并使用生物信息学方法分析比较草鱼与小鼠、牛和鸡的MHCⅠα基因多态性特征。结果:共获得了5条草鱼MHCⅠα基因型序列,其基因编码332个氨基酸,包括信号肽、α1、α2、α3和TM/CY区域。草鱼MHCⅠα基因的氨基酸变异位点主要分布在α1和α2区域,与小鼠、牛和鸡MHCⅠα基因肽结合区(PBR)空间结构相似,多态性位点分布在抗原递呈的关键部位α螺旋或β折叠上。草鱼MHCⅠα基因的进化受自然环境的负向选择作用,而其他3个物种的进化方式均为正向选择。此外,草鱼MHCⅠα基因与其他脊椎动物亲缘关系较远,单独构成进化树上一大分支,且个体间继续分化为不同的亚支。本研究从基因层面阐述了草鱼MHCⅠα基因多态性特征和分子进化规律,为进一步探究低等脊椎动物MHCⅠα基因的生物学特征奠定基础。

关键词:草鱼;MHCⅠα基因;多态性;α1和α2区域;肽结合区

基金资助:江苏省自然科学基金青年基金项目(BK20210005); 金陵科技学院高层次人才科研启动项目(jit-b-202105); 金陵科技学院2022年“科教融合”项目(2022KJRH38)