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天津师范大学学报(自然科学版)2024年第02期:基于转录组的海州香薷COPT铜转运蛋白家族鉴定及响应铜胁迫表达分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:周仲乐;马春婕;王正宁;宋文华;马晗晗;张海燕;

单位:天津师范大学生命科学学院;天津师范大学天津市动植物抗性重点实验室;铜陵市自然资源和规划局(林业局)郊区分局;

摘要:为了解海州香薷(Elsholtzia splendens)COPT(copper transporter)铜转运蛋白对铜胁迫的响应规律,运用生物信息学方法对海州香薷转录组数据库中的COPT家族成员进行鉴定与分析,构建植物表达载体探究蛋白的亚细胞定位.结果显示:海州香薷转录组中有11个EsCOPT成员,它们编码的蛋白质由72~159个氨基酸组成,等电点介于4.72~9.92,平均相对分子质量为12.870×10~3.11个成员均为膜蛋白,系统进化树分析显示EsCOPT蛋白分别属于3个亚组.正常条件下,EsCOPT2和EsCOPT9表达量较高,铜处理后,除EsCOPT5的表达无明显变化外,其他EsCOPTs的表达均呈下降趋势.全长EsCOPT9编码的蛋白具有3个跨膜结构域且N末端较短,共定位实验表明EsCOPT9-GFP定位于液泡膜上.

关键词:海州香薷;;铜转运蛋白;;铜胁迫;;转录组

基金资助:国家自然科学基金资助项目(31470292);; 天津市自然科学基金重点资助项目(18JCZDJC97900)