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天津师范大学学报(自然科学版)2024年第02期:黄嘌呤氧化酶靶向小分子抑制剂的虚拟筛选

来源:期刊VIP网 时间:


作者:陈明雪;温泽宇;宋佳;史丽颖;

单位:大连大学生命健康学院;

摘要:为了挖掘生物活性高、靶点明确的新型抗痛风药物先导化合物,以黄嘌呤氧化酶(xanthine oxidase,XOD)为靶标虚拟筛选小分子抑制剂.从PDB数据库下载XOD蛋白晶体结构,经Schr?dinger 2018中的“Protein preparation wizard”模块预处理,基于XOD活性口袋与小分子配体作用方式特征构建了3个药效团,对FDA数据库和Chemdiv数据库进行分子对接筛选.结果发现:以非布索坦与XOD对接分数-35.790 kJ/mol为阈值,筛选得到低于该分数的化合物共206个.通过类药五原则以及ADMET分析,发现有8个化合物具有较好的成药性.将此8个化合物进行结合自由能计算,其中氟芬那酸、罗索沙星、化合物6(CAS:400076-03-1,苯并吡唑类化合物)和化合物7(CAS:866050-17-1,酞嗪类化合物)与阳性对照组非布索坦的作用方式相似,能与黄嘌呤氧化酶形成稳定性较强的复合物,可作为潜在的黄嘌呤氧化酶抑制剂.

关键词:黄嘌呤氧化酶;;痛风;;药效团;;分子对接;;虚拟筛选

基金资助:辽宁省教育厅基本科研面上资助项目(LJKMZ20221837)