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作者:王迎洪;袁敏;铁海龙;刘小山;朱长军;熊廷川;
单位:新疆医科大学医学科学研究所,新疆医科大学第一附属医院健康管理学院;新疆医科大学第三临床医学院(附属肿瘤医院)妇外三科;新疆医科大学第三临床医学院(附属肿瘤医院)科技管理科;天津师范大学天津市动植物抗性重点实验室;
摘要:为了探究AKAP12对卵巢癌(ovarian cancer,OV)细胞恶性行为的特异性作用,并基于枢纽基因(hub-Genes)构建OV预后风险预测模型,应用生物信息学技术,将“ovarian cancer”作为关键词,从GeneCards数据库得到OV相关基因,通过基因表达综合数据库(GEO)筛选具有显著差异的OV相关枢纽基因并进行功能分析.通过单因素Cox回归分析筛选出与OV样本总生存期显著相关的hub-Genes;用LASSO算法构建卵巢癌预后风险预测模型,并通过Kaplan-Meier(KM)生存曲线、单因素多因素Cox回归分析以及ROC曲线检测该模型对OV患者的预后预测能力,通过SangerBox在线分析AKAP12与OV患者预后的相关性.细胞转染实现AKAP12过表达后,通过MTT实验检测细胞增殖能力,流式细胞术检测细胞凋亡能力,Transwell检测细胞侵袭能力,Western blot检测AMPK信号通路相关蛋白的表达.结果显示:(1)从GeneCards数据库中获得8 378个OV相关基因,其中82个是在正常组织与OV组织中存在显著差异的hub-Genes;(2)成功构建了基于5个hub-Genes(BIRC5、EPCAM、AKAP12、PDGFRA、CLDN4)组成的OV风险预测模型,该模型能较好地预测OV患者的预后情况;(3) SangerBox在线分析结果表明,AKAP12高表达患者的预后更差;(4)细胞实验证明,AKAP12过表达可明显促进细胞的增殖和侵袭,抑制细胞的凋亡;(5)过表达AKAP12可显著降低AMPK磷酸化水平,明显提高mTOR磷酸化水平.总之,本研究基于5个hub-Genes构建的特征风险模型能有效预测OV患者的预后情况,AKAP12可能通过AMPK/mTOR信号通路诱导OV细胞的增殖和侵袭,抑制OV细胞凋亡.
关键词:卵巢癌;;预后风险预测模型;;AKAP12;;AMPK/mTOR;;信号通路
基金资助:新疆医科大学医学科学研究所开放课题资助项目(YXYJ20230206);; 新疆维吾尔自治区自然科学基金资助项目(2023D01C128)