来源:期刊VIP网 时间:
作者:赵小波;李春娟;孙全喜;王奇;牟艺菲;王娟;苑翠玲;姜常松;单世华;
单位:山东省花生研究所;海阳市果业发展服务中心;
摘要:FAR1是一类起源于转座子酶的转录因子,在光敏色素A(phyA)信号通路的启动中起到非常重要的作用。基于全基因组水平对其家族分析,可为深入研究FAR1基因在花生生长发育、逆境胁迫响应中的分子调控机理提供依据。本研究在花生基因组中共鉴定出60个FAR1基因,该转录因子家族成员分成3个亚组,Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ亚组中分别包含了21、20和19个花生FAR1蛋白。65%直系同源基因的Ka/Ks值小于0.5,这些基因结构稳定、较为保守,经历了较强的负选择作用。转录组数据分析发现,大部分FAR1基因在花生叶片中表达。本研究结果有助于了解花生FAR1基因家族的进化与功能,为下一步深入研究该基因家族的功能提供依据。
关键词:花生;FAR1转录因子;生物信息学
基金资助:国家重点研发计划(2022YFD1000105,2022YFD1200403); 山东省现代农业产业技术体系(SDAIT-04-01); 山东省农业科学院创新工程(CXGC2023A06); 山东省农业良种工程(2020LZGC001); 山东省自然科学基金项目(ZR2023QC057); 青岛市自然科学基金青年项目(23-2-1-44-zyyd-jch)