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基因组学与应用生物学2024年第02期:化合物药物-靶标蛋白互作关联预测算法进展分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:唐春艳;钟诚;李娜;钟铭;张行健;

单位:广西大学计算机与电子信息学院;广西高校并行分布与智能计算重点实验室;

摘要:药物的使用极大地提高了人类的生存质量。药物的有效性是药物发现研究中的关键环节。药物的有效性通过识别药物与其作用的靶标蛋白来判断。然而,通过高通量筛选的实验方法分析确定化合物药物-靶标蛋白互作关联是一个十分昂贵、耗时且富有挑战性的任务。基于计算方法的化合物药物-靶标蛋白互作关联预测研究具有效率高、成本低的特点,越来越受到人们的重视。相比实验验证方法,化合物药物-靶标蛋白互作关联的计算方法可为药物发现研究后续的生物药学实验提供更为准确的潜在化合物药物-靶标蛋白候选对,达到减少生物实验的时间和成本的目的。本文回顾了近20年来基于计算方法的化合物药物-靶标蛋白互作关联预测算法所涉及的生物医学特征数据、预测方法和技术,并分析研究过程中所面临的生物医学特征数据高维稀疏,以及多源生物医学数据融合程度不高等问题,为进一步研究提供有价值的参考。

关键词:药物发现;化合物药物-靶标蛋白互作关联;生物医学特征数据;高维稀疏;数据融合

基金资助:国家自然科学基金项目(62362004,61962004)资助