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作者:张强龙;吴森;阎明毅;韩翠;余忠祥;
单位:青海大学畜牧兽医科学院;青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室;农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室;
摘要:欧拉羊(Oula sheep)属于藏羊(Tibetan sheep)的一个分支。不同于其他国内外绵羊(Ovis aries)品种,欧拉羊的公母羊皆生有大犄角。这是长期放牧条件下自然选择的结果,但其大犄角不利于现代高效畜牧业生产需求。已有较多研究把绵羊无角性状的主效控制基因定位于绵羊10号染色体上的RXFP2基因,但RXFP2基因在不同绵羊品种中的调控作用仍有差别。为加快青藏高原地区无角绵羊品种培育,本研究对青海有角型、无角型欧拉羊成年母羊各15只进行了10×深度的基因组重测序,采用F_(ST)选择性消除定位角表型主要选择基因,并对欧拉羊RXFP2基因CDS区域及上下50 kbp区域以2 000 bp窗口、 1 000 bp步长进行扫描,对获得的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)进行Tajima′s D、π、F_(ST)选择分析。结果发现,欧拉羊RXFP2基因及3′下游区域存在强选择信号。通过对RXFP2基因编码区SNP筛选,挖掘了欧拉羊中4个高质量SNPs,分别是位于RXFP2基因第9、第14外显子的同义突变(g.29458690A>G, g.29446067T>C)和第17外显子的2个非同义突变(g.29439053C>T, g.29439011C>T);突变区域均处于无角、有角欧拉羊RXFP2基因的强选择区域。本研究结果可为无角欧拉羊品种(品系)培育相关分子辅助选择工作提供技术和理论依据,有助于加快无角欧拉羊品种培育的早期选种工作。
关键词:欧拉羊(Ovis aries);无角欧拉羊;全基因组选择;分子辅助育种;RXFP2
基金资助:青海省重大科技专项(2021-NK-A5); 青海省畜牧兽医科学院基本科研业务费自主选题项目(MKY-2019-04); 农业生产发展资金-联合育种(羊)(2130122)共同资助