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作者:周瑞锋;石斌刚;王向彦;祁有鹏;何兆华;朱春娥;张雪萍;白彦斌;赵志东;胡江;
单位:甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃省草食动物生物技术重点实验室,甘肃省牛羊基因改良工程实验室;
摘要:为了分析甘南牦牛(Bos grunniens)肌肉萎缩盒蛋白32(F-box protein 32,FBXO32)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,以及基因型与胴体和肉质性状间的相关性,本研究以593头甘南牦牛为研究对象,采用混池测序和竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele specific PCR, KASP)技术,检测了甘南牦牛FBXO32基因突变位点及基因型,分析了基因型与甘南牦牛胴体及肉质性状的相关性。结果表明,从甘南牦牛FBXO32基因检测到7个SNP位点,分别是位于5′UTR区的SNP1(g.267A>C)、外显子1区的SNP2(g.326G>T)、外显子8区的SNP3(g.31231G>C),以及3′UTR区的SNP4(g.31352G>A)、 SNP5(g.31424C>T)、 SNP6(g.31503A>C)和SNP7(g.31504A>G)。其中,SNP1、 SNP4、 SNP5、 SNP6与肌肉嫩度显著相关(P<0.05), SNP3、 SNP6、 SNP7与失水率显著相关(P<0.05), SNP1、 SNP2、 SNP3、 SNP4、 SNP5、 SNP7与眼肌面积显著相关(P<0.05), SNP2、 SNP5、 SNP6与胴体重显著相关(P<0.05)。7个SNP位点构建的9种有效单倍型组合中,单倍型组合H2H2的个体肌肉嫩度小、熟肉率高,单倍型组合H1H2的个体熟肉率高、眼肌面积大、失水率低。FBXO32基因突变位点可作为甘南牦牛胴体及肉质性状潜在分子遗传标记,研究结果丰富了甘南牦牛经济性状分子遗传理论基础。
关键词:甘南牦牛(Bos grunniens);FBXO32基因;胴体性状;肉质性状;单倍型
基金资助:甘肃省高等学校产业支撑计划(2022CYZC-43); 甘肃农业大学肉牛基因组研究项目(GSAU-ZL2015-031-01)、甘肃农业大学学科团队项目(GAU-XKTD-2022-22)和甘肃农业大学公招博士科研启动项目(GAU-KYQD-2020-20)共同资助