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基因组学与应用生物学2024年第07期:基因Ⅵ型新城疫病毒时空传播动态研究

来源:期刊VIP网 时间:


作者:陈田;黄振兴;王鹏;刘林敏;韦天超;

单位:广西大学动物科学技术学院;广西壮族自治区兽用生物制品工程研究中心;广西畜禽繁育与疾病防控重点实验室;

摘要:新城疫病毒(Newcastle disease virus, NDV)是禽类最重要的疫病病原之一,其中基因Ⅵ型NDV在鸽群广泛流行,给养鸽业造成了严重的经济损失。为深入了解基因Ⅵ型NDV在世界不同地理区域和宿主间的传播动态,本研究通过病毒分离鉴定、高通量测序、完整F基因系统发育树构建和贝叶斯系统动力学等方法进行综合分析,结果获得4株广西NDV分离株,均为基因Ⅵ型。进一步的时空分析显示,基因Ⅵ型NDV最近的共同祖先时间为1972年(95%置信区间:1965~1978),估计进化速率为1.43×10~(-3) substitution/site/year(95%置信区间:1.27×10~(-3)~1.59×10~(-3));意大利是欧洲基因Ⅵ型NDV早期的外溢传播中心,该病毒从欧洲传播至我国,随后华东和华南成为我国的主要传播中心;病毒存在从鸽(Columba livia)到野鸟和鸡(Gallus gallus)、从野鸟到鹌鹑(Coturnix coturnix)等的跨物种传播,但病毒传播最重要的宿主是鸽。分析结果表明基因Ⅵ型NDV正快速进化,有作为突变库的潜在威胁。基于“One Health”理念,应在全球范围内加强主动监测,改善家禽管理策略,避免不同家禽之间及不同家禽与野鸟之间的直接和间接接触。这些信息有助于了解基因Ⅵ型NDV的起源、传播与进化,为制定相应防控策略提供科学依据。

关键词:新城疫病毒;基因Ⅵ型;系统发育分析;时空分析

基金资助:广西科技重大专项(桂科AA23062050); 广西重点研发计划项目(桂科AB23026082)共同资助