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兰州大学学报(自然科学版)2024年第02期:转录组分析揭示荷叶离褶伞菌多糖LDS-1抗小鼠S180肿瘤的分子机制

来源:期刊VIP网 时间:


作者:王艺学;刘影;赵倪慧;卢睿加;侯怡铃;丁祥;

单位:西华师范大学环境科学与工程学院,嘉陵江流域生态环境保护与污染防治南充市重点实验室;西华师范大学生命科学学院,西南野生动植物资源保护教育部重点实验室;

摘要:以荷叶离褶伞菌多糖LDS-1、甘露聚糖肽和空白对照作用下的小鼠S180肿瘤细胞为研究材料,运用RNA-Seq测序技术进行生物信息学分析,结果显示LDS-1组、甘露聚糖肽组和空白对照组分别获得8.27、 8.35和8.97 G的分析数据.高表达基因(FPKM>2 200)分析显示LDS-1主要通过下调Rplp1基因调控细胞分裂,将S180细胞停滞在G1期以抑制其分裂.差异基因分析结果显示LDS-1主要通过上调Alb、 Timp4、 Apoa1基因调节蛋白表达或者细胞黏连性,抑制S180肿瘤细胞迁移.KEGG(京都基因与基因组百科全书)通路富集结果显示, LDS-1抑制S180肿瘤生长的关键基因主要富集在过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路中,上游Fabp3基因下调,激活下游Apoa1、Slc27a2和Adipoq等多个基因上调,调控S180细胞的脂质代谢和胆固醇代谢. LDS-1能够通过调控高表达关键基因Rplp1,差异表达关键基因Alb、 Timp4、 Apoa1,以及PPAR信号通路抑制S180肿瘤细胞的增殖分裂、能量获取和迁移侵袭.

关键词:荷叶离褶伞菌;;多糖;;S180肿瘤;;RNA-Seq测序;;差异表达基因;;PPAR信号通路

基金资助:四川省科技厅应用基础面上项目(2022NSFSC0107);四川省科技厅农业科技成果转化资金项目(2022NZZJ0003);; 四川省转移支付科技成果转移转化示范项目(22ZYZFSF0009,23ZHSF0082)