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作者:刘筠;李效雄;杜雨;马瑞;胡晓桐;柳迪;贾西贝;马彦军;
单位:甘肃农业大学林学院;兰州资源环境职业技术大学;
摘要:对黑果枸杞Double B-box(DBB)基因家族测序并进行生物信息学分析,以深入研究LrDBB基因的功能.以NaCl溶液处理黑果枸杞转录组数据库为基础,对黑果枸杞DBB基因家族成员进行鉴定和分析.黑果枸杞转录组数据中共筛选出32个DBB家族成员,分为5个亚家族,蛋白质亚细胞定位预测中其家族成员主要定位于细胞核.黑果枸杞DBB家族蛋白质分子量为5 156.83~53 308.44D;等电点4.58~8.96;总原子数692~7 324;氨基酸个数46~476 aa;脂溶指数51.06~92.88;大多数蛋白质成员为不稳定蛋白质和亲水蛋白质. LrDBB家族的蛋白质N端均具有B-box保守结构域,无规则卷曲和α-螺旋占比较大.表达模式中发现, NaCl胁迫株的根和叶中均有LrDBB基因家族成员出现高表达量.在NaCl胁迫下黑果枸杞DBB基因于不同器官中的表达量存在明显差异,推断此家族基因可能在盐胁迫中起调控作用.
关键词:黑果枸杞;;NaCl胁迫;;DBB转录因子;;生物信息学分析
基金资助:兰州资源环境职业技术大学重点研究项目(X2022ZD-05);; 甘肃省高校产业支撑计划项目(2023CYZC-46);; 兰州市科技计划项目(2022-2-22)