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水生态学杂志2025年第04期:基于线粒体COI基因序列的中国蚬属遗传多样性和结构分析

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作者:胡锦硕;邓亚菲;周春花;王维开;刘雄军;欧阳珊;吴小平;

单位:南昌大学生命科学学院;南昌大学鄱阳湖环境与资源利用教育部重点实验室;江西省流域生态演变与生物多样性重点实验室;

摘要:分析中国蚬属不同地理种群的遗传多样性,为蚬属资源保护和可持续开发利用提供参考,也为蚬属分类及地理分布研究提供理论依据。利用线粒体COI基因为分子标记,对2019年采自我国4大流域的13个蚬属地理种群(共计362个样本)进行遗传多样性和遗传结构研究,构建单倍型系统发育树,并进行种群历史动态分析。结果显示:线粒体COI片段长度为550 bp,碱基AT含量明显大于GC含量,碱基组成具有偏好性;362个蚬属样本共检测到40个单倍型,单倍型多样性(H_d)和核苷酸多样性(π)分别为0.812和0.029 08,军山湖(JS)具有低H_d和低π,13个种群中9个种群具有高的遗传多样性水平;系统发育树和网络图均支持中国蚬属分为淡水支和河口支,淡水支包括谱系Ⅰ和谱系Ⅱ,河口支为谱系Ⅲ;长江流域和珠江流域的种群全归于淡水支,淮河流域的种群在2支中均有分布,而东南沿海诸河流域的种群多分布在河口支,蚬属的3个谱系在不同流域中的分布呈现出明显的区域性;13个岘属种群间遗传分化系数F_(ST)为0.003~0.089,其中甬江(YJ)种群与其他种群之间的FST最大(0.063~0.089)。遗传分化和基因流分析表明蚬属种群基因交流普遍。种群动态分析除巢湖种群在末次间冰期经历种群扩张外,其他种群均稳定。

关键词:蚬属;COI基因;谱系组成;遗传多样性

基金资助:江西省“科技+水利”联合计划项目(202306)