来源:期刊VIP网 时间:
作者:丁燮;张伟;王晓晓;郑召鹏;
单位:遵义医科大学研究生院;贵州省人民医院肿瘤科;贵州医科大学附属医院皮肤科;
摘要:目的 探究吲哚胺2,3双加氧酶1(indoleamine 2,3 dioxygenase 1,IDO1)在人体不同肿瘤组织中的表达及其在肿瘤微环境中发挥的作用。方法利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据集,GEPIA2、TIMER2.0、Linked Omics等在线网站,从基因表达、生存预后和免疫浸润等方面探讨IDO1基因在不同肿瘤发病机制中的作用;利用GEPIA2数据库获取IDO1基因相关基因进行基因本体(gene ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析;同时对IDO1基因在黑色素瘤中的保护作用机制进行了GO及KEGG富集分析。结果 与正常组织相比,IDO1在13种肿瘤组织中表达上调;Cox比例风险回归模型显示IDO1的高表达与大多数肿瘤患者的不良预后相关;但在皮肤黑色素瘤(skin cutaneous melanoma,SKCM)、头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSC)中,IDO1的高表达与更长的总生存期(overall survival,OS)和疾病特异性生存期(disease-specific survival,DSS)相关;免疫浸润分析显示IDO1与M1型巨噬细胞表现出强烈正相关性,而与多种肿瘤浸润免疫细胞呈负相关;KEGG通路富集分析显示IDO1主要参与调节机体免疫反应,在皮肤黑色素瘤中,KEGG通路富集分析主要集中在“抗原加工和呈递”及“Th1和Th2细胞分化”。结论 IDO1基因表达与临床预后及肿瘤微环境中免疫细胞浸润等具有相关性,IDO1主要通过影响机体免疫反应进而影响肿瘤的发生及发展。
关键词:吲哚胺2,3双加氧酶1;;泛癌分析;;生存预后;;免疫浸润;;富集分析
基金资助:贵州省卫健委科学技术基金(gzwjkj2020-1-238);; 贵州省高层次创新型人才项目(gzwjrs2024-004)~~