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作者:朱忠正;靳军霞;马晓芹;晁小珊;高赟;汪烘宇;富玉姣;张贝贝;丁军涛;
单位:新疆大学生命科学与技术学院病原微生物学实验室,新疆生物资源基因工程重点实验室;
摘要:目的 调查新疆维吾尔自治区(新疆)准噶尔盆地东南部地区蜱媒病毒的多样性。方法 2023年4月底在新疆准噶尔盆地东南部地区阜康县(44°23′N,88°8′E)和奇台县(44°11′N, 89°37′E)两地的半沙漠采样点采集蜱样本,并进行形态与分子生物学鉴定;分别按采样地点以及蜱种不同将采集到的蜱分为若干组,每组选取15只同种蜱,提取总的病毒RNA,构建cDNA文库后在Illumina Hiseq 2500平台上进行测序,运用生物信息学工具对测序结果进行病毒组分分析,探究病毒的多样性;使用Gtest检验方法比较两地蜱媒病毒组成的差异;使用聚合酶链式反应(PCR)方法对分析的病毒序列进行验证。结果 本研究共采集蜱189只,经鉴定均为亚洲璃眼蜱。按采样地点不同将蜱样本分为FK和QT两组进行宏基因组学研究,病毒物种注释结果显示,两组样本共有57条contigs与病毒基因组序列相匹配,匹配到的病毒基因组分别属于楚病毒科、白蛉纤细病毒科、全病毒科、弹状病毒科、戊型肝炎病毒科和未分类的病毒科;经组间差异比较,除Kashgar Totiv tick virus 1外,博乐蜱病毒1(P=1×10~(-15))、博乐蜱病毒3(P=3.71×10~(-3))、泰顺蜱病毒(P=5.95×10~(-5))、博乐蜱病毒4(P=7.45×10~(-4))、Bole hyalomma asiaticum virus 1(P=1.72×10~(-8)),Lonestar tick totivirus(P=1.11×10~(-6))在两样本间丰度差异有统计学意义;为了验证上述结果,根据已鉴定的7种病毒的基因组序列设计9对引物进行PCR扩增验证,最终证明了博乐蜱病毒1、博乐蜱病毒3、 Taishun Tick Virus以及Bole hyalomma asiaticum virus这4种病毒的存在。结论 准噶尔盆地东南部地区亚洲璃眼蜱所携带的蜱媒病毒组成复杂,阜康和奇台两县蜱媒病毒丰度存在明显差异,通过PCR技术证实了其中4种病毒的存在。
关键词:蜱;;蜱媒病毒;;宏基因组学;;系统发育分析
基金资助:国家自然科学基金(No.81960369)~~