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作者:梁爽;王彩乔;栾阳;钟瑞;李慎;马琳;朱妮;邱琳;刘东立;
单位:陕西省疾病预防控制中心;榆林市疾病预防控制中心;西安市疾病预防控制中心;
摘要:目的 了解陕西省靖边县一起炭疽疫情的流行病学特征,以及炭疽芽孢杆菌分离株的病原学特征和全基因组溯源情况,以期为该病的防治提供参考。方法 2024年8月陕西省靖边县发生1起炭疽疫情,采集涉疫生物、环境样本,进行核酸鉴定和细菌分离,对分离株进行药物敏感性试验和全基因组测序,对耐药基因、毒力基因作出分析,进行核心基因组多位点序列(cgMLST)分析、核心基因组单核苷酸变异(cgSNP)分析。结果 本起炭疽疫情共报告3例皮肤炭疽病例,时间跨度为2024年8月2—21日,共获得3株炭疽芽孢杆菌,分离率为12.00%(3/25);分离株对临床首选药物青霉素、四环素、环丙沙星敏感;全基因组分析发现携带毒力基因capA、capB、capC、dep/capD、capE、cya、inhA、lef和pagA;携带β-内酰胺类(bla)、碳青霉烯类(bla2)、磷霉素(fosB2)、链丝菌素(sat A)抗生素耐药基因;cgMLST及cgSNP分析显示3株菌聚为一个Cluster,与2018年西安市鄠邑区、2021年渭南市蒲城县、2020年渭南市临渭区、渭南市澄城县分离株遗传距离较近,与2021年华阴市、2015年延安市甘泉县分离株遗传距离较远。结论 本起炭疽疫情是由同一炭疽传染源引起,但与陕西省历史分离株无明显关联,靖边县历史上鲜有炭疽疫情发生,可认定为一个新发现的疫源地,为今后炭疽疫情的长期监测与防治提供依据。
关键词:炭疽芽孢杆菌;;抗生素耐药分析;;全基因组测序;;核心基因组多位点序列分型;;核心基因组单核苷酸多态性分析
基金资助:陕西省重点研发计划(No.2023-YBSF-633,No.2025SF-YBXM-234)~~