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作者：奈日乐;谢遇春;刘志红;满都呼;
单位：呼伦贝尔学院农学院;河北科技师范学院动物科技学院;内蒙古农业大学动物科学学院;
摘要：次级毛囊的退行本质是毛囊细胞凋亡的过程，本研究从蛋白质组学层面探究该过程的相关蛋白表达，为初步揭示内蒙古绒山羊皮肤次级毛囊凋亡系统的分子调控机制奠定基础。本研究采用SWATH技术，通过比较内蒙古绒山羊9月份（生长旺盛期）与1月份（退行期）的皮肤样本，筛选次级毛囊退行过程中的差异蛋白，并对差异蛋白进行生物信息学分析。结果显示，1%FDR（假阳性）条件下，检测到退行期表达蛋白1 792个，生长期表达蛋白2 199个；筛选出164个退行期特异表达蛋白。并以P<0.05、FC（差异倍数）>2或FC<0.5作为阈值，筛选出内蒙古绒山羊皮肤毛囊退行期与生长期的差异蛋白504个，其中退行期上调蛋白250个，下调蛋白254个。退行期特异表达蛋白主要参与生物学过程（Biological process,BP）的氧化还原过程（Oxidation-reduction process）等功能；在细胞组分（Cellular component,CC）中，它们主要富集于胞外外泌体（Extracellular exosome）中；在分子功能（Molecular function,MF）中，它们主要参与poly(A)RNA结合等功能。差异蛋白在BP中，主要参与翻译（Translation）等功能；在CC中，主要富集于胞外外泌体中；在MF中，参与poly(A)RNA结合功能。KEGG富集分析结果表明，退行期特异表达蛋白与差异蛋白均主要富集于代谢通路（Metabolic pathway），且退行期中富集于TGF-beta信号通路的上调蛋白有PPP2CB、THBS1、Rhoa、TGFB1、Skp1等，下调的蛋白有DCN。从PPI网络中筛选出28个枢纽蛋白，其中16个为核糖体蛋白，占比达57%。综上，TGF-beta信号通路和核糖体蛋白在毛囊退行中起关键调控作用。
关键词：内蒙古绒山羊;;次级毛囊;;生长期;;退行期;;蛋白质组学
基金资助：呼伦贝尔学院博士基金项目（2020BS12,2023BSJJ08）;呼伦贝尔学院自然科学一般项目（2020ZKYB14）
